El programa de Investigación en Trigo se viene desarrollando a través de introducciones procedente de otros países, principalmente del Brasil. Simultáneamente se cuenta con germoplasma procedente del CIMMYT de México y a su vez se está utilizando la tecnología de Selección individual con la finalidad de determinar materiales que se adapten a las condiciones ambientales de nuestra región.
Fundamentalmente se buscan cualidades como tolerancia a las principales enfermedades entre las que figura la Roya, Piricularia y Helmintosporium. Asimismo se busca mayor potencial genético de rendimiento a través de la optimización de los componentes del rendimiento a fin de proporcionar variedades con mejores cualidades que las tradicionales.